我爸爸和我弟有两个宅基地，我弟单独立户了，我爸把他的老宅基地和我弟换了

您提到村上想要收回您父亲的宅基地，根据《土地管理法》及相关规定，宅基地使用权在特定情形下可被收回。但根据您所述，您父亲与弟弟已进行宅基地互换并在房管局备案，且都建有国家补贴的抗震房，这并未显示存在上述收回情形中的任何一种，如擅自改变用途、长期未使用或非法转让等。因此，若村上无故收回，可能涉嫌违法。建议了解具体原因，必要时可寻求法律援助或提起诉讼维护权益。
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从法律角度，保护宅基地使用权需做到：确保宅基地使用合法合规，不擅自改变用途；保留好宅基地使用权证及相关交易、备案文件；了解并遵守《土地管理法》关于宅基地使用的规定；若遇权益受损，及时收集证据并向当地土地管理部门反映或寻求法律援助，必要时可通过法律途径维权。
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若村上坚持收回，首先，应明确收回的具体理由，对照《土地管理法》中关于宅基地使用权收回的规定，判断其合法性。其次，若认为收回行为不合法，可准备相关证据，如宅基地使用权证、互换协议及备案证明等，向当地土地管理部门申诉或请求法律援助。最后，若协商无果，可考虑通过法律途径解决争议。